Christoph Karrer (* 20. Januar 1947 in Kempten) ist ein deutscher Musiker und Komponist. Er ist Gründungsmitglied von Amon Düül und bekannt für seine Zusammenarbeit mit Embryo und Ernst Fuchs. Er spielt Gitarre, Oud, Violine und Saxophon.
Mit 12 Jahren begann Karrer Banjo und Sopransaxophon zu spielen. Nachdem er auf dem Internat in Marktoberdorf die Hochschulreife erlangte, ging er zum Studium an die Kunsthochschule in München. Im Jahr 1967 gründete er mit Peter Leopold, Dieter Serfas und anderen die Band Amon Düül. Mit seiner Band, Amon Düül II, trat Karrer 1970 im legendären Beat-Club auf.